明日方舟的安卓和iOS平台之间存在部分互通性。尽管游戏数据如角色、任务等可以共享，但充值系统存在限制。安卓和iOS用户的源石购买是分开的，即在安卓设备上充值只能用于安卓，而iOS设备的充值只能在iOS上使用。因此，对于尚未能在iOS上游戏的玩家，可以选择使用安卓模拟器先进行游戏，然后将获取的源石转换为合成玉后再切换回iOS设备，以确保数据的迁移。
苹果和安卓平台的差异体现在应用分发和费用处理上。在iOS上，像《明日方舟》这样包含付费内容的应用，需要支付30%的“苹果税”。如果安卓用户希望将游戏数据带到iOS，那么这部分费用苹果是不允许减免的。这也是为什么许多游戏在数据互通的同时，仍保留一部分限制。《明日方舟》虽然实现了数据互通，但仍有其他游戏保持了独立的平台规则。
